职能管理部门（20个）：党委办公室、行政办公室、纪检监察室、宣传科、人力资源科、财务科、审计科、医务部、护理部、运营管理部、资产管理部（下含医疗设备科）、科教科、客户服务部、感染管理科、公共卫生管理科、信息科、医疗保险管理办公室、安全保卫科、总务科、老干部管理科。

临床科室（45）：呼吸与危重症医学科、消化内科、肿瘤科、血液内科、内分泌科、神经内科、心血管内科、全科医学科、儿科、肾病学科、重症医学科、感染性疾病科、麻醉科、耳鼻咽喉头颈外科、眼科、神经外科、泌尿外科、普外一科、普外二科、产科、妇科、骨一科、骨二科、胸外科、小儿外科、中医骨伤科、中医风湿病科、中医肛肠科、中医康复科、门诊部（下含干部保健科、中医门诊）、急诊科、德宏州急救中心、口腔科、皮肤科、健康管理中心、疼痛科、宁养院、老年病科、干部医疗科、康复医学科、风湿免疫科、中医内科、临床营养科、整形修复美容外科、心脏大血管外科。

医技科室（9个）：药剂科、检验科、病理科、医学影像科、超声科、针灸推拿科、输血科、核医学科、消毒供应中心。